Når sprøytearbeidet er avsluttet skylles tanken godt med vann. Fortynn restene av sprøytevæske ca. fem ganger og sprøyt innholdet over kulturen, slik som beskrevet på etiketten. Gjøres dette umiddelbart etter endt sprøyting er en mer sikret at utstyret blir mest mulig reint.
Etter endt sprøytesesong eller før behandling av ømfintlige planter, bør sprøyteutstyret vaskes med anbefalt vaskemiddel etter at væskerester er fortynnet og sprøytet ut. Rengjøring skal gjøres på et sted hvor det er liten fare for forurensning. Skyllevann skal aldri helles ut i sluk, men kan spres fortynnet utover den aktuelle kulturen eller annet egnet grasdekket areal (aktiv og bindende jord som for eksempel leire/morenejord med torv/grasvekst øverst). Sandjord og annen lett drenerbar jord må unngås.
Skyll gjennom slanger før dysene påsettes for å unngå senere tiltetting av ulike forurensninger. Hvis det er fare for frost, blandes det frostvæske på tanken (50 % vann) og sprøytes ut gjennom slanger og dyser. Utstyret bør lagres frostfritt. Der det brukes uttrekkbar slange, kan det være praktisk vanskelig å skylle tilførselsledningen på vanlig måte. Dette fordi det lett kan være over 10-20 liter sprøytevæske igjen i en 50- 100 meter lang ledning. Hvis dette sprøytes direkte ut, kan det oppstå sviskade. Når sprøytinga igjen skal starte, har vi et nytt problem fordi det vil ta flere minutter å fortrenge vannet i slangen og oppnå en jevn konsentrasjon. Begge disse problemene kan lettest løses ved å stikke dysepistolen ned i tanken og sprøyte væska i sirkulasjon tilbake i tank inntil en jevn konsentrasjon er oppnådd. Er det under skylling, vil væskemengden i ledningen bli uttynnet og deretter sprøytes ut over et biologisk aktivt areal. Er det under oppstart der det på forhånd er vann i ledningen, vil en på denne måte sikre seg en jevn konsentrasjon i ledning og tank og biologisk virkning med en gang man sprøyter. Det viktig med en totalreingjøring ved bruk av spesielle preparater og følsomme kulturer og ved avsluttet kultursesong. For mindre sprøyter uten lange slanger gjelder vanlig skylling og rengjøring som beskrevet i grunnboka. Hvis det brukes utstyr med svært konsentrert væske, vil det være behov for hyppigere reingjøring.
Ryggsprøyter er dessverre ikke utstyrt med bunnplugg som kan åpnes slik som for åkersprøyter (grunnet sikkerhet mot mulig lekkasje). Men du må aldri snu en ryggsprøyte på hodet for å tømme ut evnt væskerester. Det fører bare til at sprøytevæske renner ut på utsiden av sprøyta. For å tømme tanken tar du i stedet og skrur ut dysen (bruker hansker), så renner tanken raskt tom ut av slangen på en sikker måte (eventuelt under utpumping). Da er det også lettere å samle opp væskerestene og tanken renner nesten helt tom.